BATF2

BATF2 (англ. Basic leucine zipper ATF-like transcription factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 274 амінокислот, а молекулярна маса — 29 398.

BATF2
Ідентифікатори
Символи	BATF2, SARI, basic leucine zipper ATF-like transcription factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 614983 MGI: 1921731 HomoloGene: 12569 GeneCards: BATF2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • myeloid dendritic cell differentiation • defense response to protozoan Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	116071	74481
Ensembl	ENSG00000168062	ENSMUSG00000039699
UniProt	Q8N1L9	Q8R1H8
RefSeq (мРНК)	NM_001300807 NM_001300808 NM_138456	NM_028967 NM_001356604 NM_001379529
RefSeq (білок)	NP_001287736 NP_001287737 NP_612465	NP_083243 NP_001343533 NP_001366458
Локус (UCSC)	Хр. 11: 64.99 – 65 Mb	Хр. 19: 6.19 – 6.22 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHLCGGNGLL		TQTDPKEQQR		QLKKQKNRAA		AQRSRQKHTD		KADALHQQHE
SLEKDNLALR		KEIQSLQAEL		AWWSRTLHVH		ERLCPMDCAS		CSAPGLLGCW
DQAEGLLGPG		PQGQHGCREQ		LELFQTPGSC		YPAQPLSPGP		QPHDSPSLLQ
CPLPSLSLGP		AVVAEPPVQL		SPSPLLFASH		TGSSLQGSSS		KLSALQPSLT
AQTAPPQPLE		LEHPTRGKLG		SSPDNPSSAL		GLARLQSREH		KPALSAATWQ
GLVVDPSPHP		LLAFPLLSSA		QVHF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11