ASF1A

ASF1A (англ. Anti-silencing function 1A histone chaperone) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 204 амінокислот, а молекулярна маса — 22 969.

ASF1A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1TEY, 2I32, 2IIJ, 2IO5, 3AAD, 5C3I
Ідентифікатори
Символи	ASF1A, CGI-98, CIA, HSPC146, anti-silencing function 1A histone chaperone
Зовнішні ІД	OMIM: 609189 MGI: 1913653 HomoloGene: 8528 GeneCards: ASF1A
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0031493 histone binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • GO:0034723 DNA replication-dependent chromatin assembly • muscle cell differentiation • nucleosome assembly • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0100026 Репарація ДНК • osteoblast differentiation • transcription, DNA-templated • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25842	66403
Ensembl	ENSG00000111875	ENSMUSG00000019857
UniProt	Q9Y294	Q9CQE6
RefSeq (мРНК)	NM_014034	NM_025541
RefSeq (білок)	NP_054753	NP_079817
Локус (UCSC)	Хр. 6: 118.89 – 118.91 Mb	Хр. 10: 53.47 – 53.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAKVQVNNVV		VLDNPSPFYN		PFQFEITFEC		IEDLSEDLEW		KIIYVGSAES
EEYDQVLDSV		LVGPVPAGRH		MFVFQADAPN		PGLIPDADAV		GVTVVLITCT
YRGQEFIRVG		YYVNNEYTET		ELRENPPVKP		DFSKLQRNIL		ASNPRVTRFH
INWEDNTEKL		EDAESSNPNL		QSLLSTDALP		SASKGWSTSE		NSLNVMLESH
MDCM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до шаперонів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у ядрі.

Література

• Munakata T., Adachi N., Yokoyama N., Kuzuhara T., Horikoshi M. (2000). A human homologue of yeast anti-silencing factor has histone chaperone activity. Genes Cells. 5: 221—233. PMID 10759893 DOI:10.1046/j.1365-2443.2000.00319.x
• Sillje H.H.W., Nigg E.A. (2001). Identification of human Asf1 chromatin assembly factors as substrates of Tousled-like kinases. Curr. Biol. 11: 1068—1073. PMID 11470414 DOI:10.1016/S0960-9822(01)00298-6
• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chimura T., Kuzuhara T., Horikoshi M. (2002). Identification and characterization of CIA/ASF1 as an interactor of bromodomains associated with TFIID. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 9334—9339. PMID 12093919 DOI:10.1073/pnas.142627899
• Umehara T., Horikoshi M. (2003). Transcription initiation factor IID-interactive histone chaperone CIA-II implicated in mammalian spermatogenesis. J. Biol. Chem. 278: 35660—35667. PMID 12842904 DOI:10.1074/jbc.M303549200

Див. також

• Хромосома 6