ARHGEF40

ARHGEF40 (англ. Rho guanine nucleotide exchange factor 40) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 519 амінокислот, а молекулярна маса — 164 658.

ARHGEF40
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DX1, 2PZ1, 3NMX, 3NMZ
Ідентифікатори
Символи	ARHGEF40, SOLO, Rho guanine nucleotide exchange factor 40
Зовнішні ІД	OMIM: 610018 MGI: 2685515 HomoloGene: 19560 GeneCards: ARHGEF40
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity Клітинна компонента • цитоплазма Біологічний процес • regulation of Rho protein signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55701	268739
Ensembl	ENSG00000165801	ENSMUSG00000004562
UniProt	Q8TER5	Q3UPH7
RefSeq (мРНК)	NM_001278529 NM_001278530 NM_018071	NM_001145921 NM_001145922 NM_198249
RefSeq (білок)	NP_001265458 NP_001265459 NP_060541	NP_001139393 NP_001139394 NP_937892
Локус (UCSC)	Хр. 14: 21.07 – 21.09 Mb	Хр. 14: 52.22 – 52.24 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEPEPVEDCV		QSTLAALYPP		FEATAPTLLG		QVFQVVERTY		REDALRYTLD
FLVPAKHLLA		KVQQEACAQY		SGFLFFHEGW		PLCLHEQVVV		QLAALPWQLL
RPGDFYLQVV		PSAAQAPRLA		LKCLAPGGGR		VQEVPVPNEA		CAYLFTPEWL
QGINKDRPTG		RLSTCLLSAP		SGIQRLPWAE		LICPRFVHKE		GLMVGHQPST
LPPELPSGPP		GLPSPPLPEE		ALGTRSPGDG		HNAPVEGPEG		EYVELLEVTL
PVRGSPTDAE		GSPGLSRVRT		VPTRKGAGGK		GRHRRHRAWM		HQKGLGPRGQ
DGARPPGEGS		STGASPESPP		GAEAVPEAAV		LEVSEPPAEA		VGEASGSCPL
RPGELRGGGG		GGQGAEGPPG		TPRRTGKGNR		RKKRAAGRGA		LSRGGDSAPL
SPGDKEDASH		QEALGNLPSP		SEHKLPECHL		VKEEYEGSGK		PESEPKELKT
AGEKEPQLSE		ACGPTEEGAG		ERELEGPGLL		CMAGHTGPEG		PLSDTPTPPL
ETVQEGKGDN		IPEEALAVSV		SDHPDVAWDL		MASGFLILTG		GVDQSGRALL
TITPPCPPEE		PPPSRDTLNT		TLHYLHSLLR		PDLQTLGLSV		LLDLRQAPPL
PPALIPALSQ		LQDSGDPPLV		QRLLILIHDD		LPTELCGFQG		AEVLSENDLK
RVAKPEELQW		ELGGHRDPSP		SHWVEIHQEV		VRLCRLCQGV		LGSVRQAIEE
LEGAAEPEEE		EAVGMPKPLQ		KVLADPRLTA		LQRDGGAILM		RLRSTPSSKL
EGQGPATLYQ		EVDEAIHQLV		RLSNLHVQQQ		EQRQCLRRLQ		QVLQWLSGPG
EEQLASFAMP		GDTLSALQET		ELRFRAFSAE		VQERLAQARE		ALALEENATS
QKVLDIFEQR		LEQVESGLHR		ALRLQRFFQQ		AHEWVDEGFA		RLAGAGPGRE
AVLAALALRR		APEPSAGTFQ		EMRALALDLG		SPAALREWGR		CQARCQELER
RIQQHVGEEA		SPRGYRRRRA		DGASSGGAQW		GPRSPSPSLS		SLLLPSSPGP
RPAPSHCSLA		PCGEDYEEEG		PELAPEAEGR		PPRAVLIRGL		EVTSTEVVDR
TCSPREHVLL		GRARGPDGPW		GVGTPRMERK		RSISAQQRLV		SELIACEQDY
VATLSEPVPP		PGPELTPELR		GTWAAALSAR		ERLRSFHRTH		FLRELQGCAT
HPLRIGACFL		RHGDQFSLYA		QYVKHRHKLE		NGLAALSPLS		KGSMEAGPYL
PRALQQPLEQ		LTRYGRLLEE		LLREAGPELS		SECRALGAAV		QLLREQEARG
RDLLAVEAVR		GCEIDLKEQG		QLLHRDPFTV		ICGRKKCLRH		VFLFEHLLLF
SKLKGPEGGS		EMFVYKQAFK		TADMGLTENI		GDSGLCFELW		FRRRRAREAY
TLQATSPEIK		LKWTSSIAQL		LWRQAAHNKE		LRVQQMVSMG		IGNKPFLDIK
ALGERTLSAL		LTGRAARTRA		SVAVSSFEHA		GPSLPGLSPG		ACSLPARVEE
EAWDLDVKQI		SLAPETLDSS		GDVSPGPRNS		PSLQPPHPGS		STPTLASRGI
LGLSRQSHAR		ALSDPTTPL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 14