ARF6

ARF6
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1E0S, 2A5D, 2A5F, 2A5G, 2BAO, 2BAU, 2J5X, 2W83, 3LVQ, 3LVR, 4FME, 3N5C, 3PCR, 4KAX
Ідентифікатори
Символи	ARF6, ADP-ribosylation factor 6, ADP ribosylation factor 6
Зовнішні ІД	OMIM: 600464 MGI: 99435 HomoloGene: 1256 GeneCards: ARF6
Реагує на сполуку
	Viroporin 3a
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • protein N-terminus binding; • GTP binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0006184 GTPase activity; • thioesterase binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • recycling endosome; • ендосома; • комплекс Ґольджі; • cell projection; • мембрана; • focal adhesion; • ruffle; • myelin sheath; • клітинна мембрана; • endocytic vesicle; • внутрішньоклітинний; • cell cortex; • early endosome; • endosome membrane; • екзосома; • filopodium membrane; • recycling endosome membrane; • Борозна розщеплення; • гіалоплазма; • Flemming body; • early endosome membrane; • presynapse; • glutamatergic synapse;
Біологічний процес	• establishment of epithelial cell polarity; • диференціація клітин; • regulation of filopodium assembly; • positive regulation of actin filament polymerization; • ruffle organization; • small GTPase mediated signal transduction; • regulation of Rac protein signal transduction; • нейробіологія розвитку; • negative regulation of dendrite development; • поділ клітини; • negative regulation of receptor-mediated endocytosis; • адгезія клітин; • protein localization to cell surface; • protein transport; • protein localization to endosome; • клітинний цикл; • liver development; • myeloid cell apoptotic process; • GO:0033109 cortical actin cytoskeleton organization; • vesicle-mediated transport; • regulation of dendritic spine development; • hepatocyte apoptotic process; • GO:0015915 транспорт; • positive regulation of protein localization to plasma membrane; • intracellular protein transport; • regulation of neuron projection development; • endocytic recycling; • synaptic vesicle endocytosis; • positive regulation of keratinocyte migration; • ruffle assembly; • maintenance of postsynaptic density structure; • positive regulation of adherens junction organization; • regulation of presynapse assembly; • cellular response to nerve growth factor stimulus; • negative regulation of protein localization to cell surface; • positive regulation of protein secretion; • positive regulation of protein homodimerization activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	382
	11845
	ENSG00000165527
	ENSMUSG00000044147
	P62330
	P62331
	NM_001663
	NM_007481
	NP_001654
	NP_031507
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ARF6 (англ. ADP ribosylation factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 175 амінокислот, а молекулярна маса — 20 082^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGKVLSKIFG	NKEMRILMLG	LDAAGKTTIL	YKLKLGQSVT	TIPTVGFNVE
TVTYKNVKFN	VWDVGGQDKI	RPLWRHYYTG	TQGLIFVVDC	ADRDRIDEAR
QELHRIINDR	EMRDAIILIF	ANKQDLPDAM	KPHEIQEKLG	LTRIRDRNWY
VQPSCATSGD	GLYEGLTWLT	SNYKS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, диференціація клітин, нейрогенез. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках, апараті гольджі, ендосомах.

Література ред.

Lebeda R.A., Johnson S.K., Stewart M.I., Haun R.S. (2003). Sequence, genomic organization, and expression of the human ADP-ribosylation factor 6 (ARF6) gene: a class III ARF. DNA Cell Biol. 22: 737—741. PMID 14659046 DOI:10.1089/104454903770946719
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
D'Souza-Schorey C., Stahl P.D. (1995). Myristoylation is required for the intracellular localization and endocytic function of ARF6. Exp. Cell Res. 221: 153—159. PMID 7589240 DOI:10.1006/excr.1995.1362
Gauthier-Campbell C., Bredt D.S., Murphy T.H., El-Husseini A. (2004). Regulation of dendritic branching and filopodia formation in hippocampal neurons by specific acylated protein motifs. Mol. Biol. Cell. 15: 2205—2217. PMID 14978216 DOI:10.1091/mbc.E03-07-0493
Garcia-Gonzalo F.R., Bartrons R., Ventura F., Rosa J.L. (2005). Requirement of phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate for HERC1-mediated guanine nucleotide release from ARF proteins. FEBS Lett. 579: 343—348. PMID 15642342 DOI:10.1016/j.febslet.2004.11.095
Hofmann I., Thompson A., Sanderson C.M., Munro S. (2007). The Arl4 family of small G proteins can recruit the cytohesin Arf6 exchange factors to the plasma membrane. Curr. Biol. 17: 711—716. PMID 17398095 DOI:10.1016/j.cub.2007.03.007