ALKBH1

ALKBH1
Ідентифікатори
Символи	ALKBH1, ABH, ABH1, ALKBH, alkB, hABH, alkB homolog 1, histone H2A dioxygenase
Зовнішні ІД	OMIM: 605345 MGI: 2384034 HomoloGene: 4393 GeneCards: ALKBH1
шифр КФ	4.2.99.18
Онтологія гена
Молекулярна функція	• methylcytosine dioxygenase activity; • dioxygenase activity; • зв'язування з іоном металу; • каталітична активність; • lyase activity; • chemoattractant activity; • oxidoreductase activity; • ferrous iron binding; • tRNA binding; • 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity; • DNA-N1-methyladenine dioxygenase activity; • tRNA demethylase activity; • class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity; • DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity;
Клітинна компонента	• мітохондрія; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process; • диференціація клітин; • DNA dealkylation involved in DNA repair; • placenta development; • neuron migration; • in utero embryonic development; • cellular response to DNA damage stimulus; • oxidative demethylation; • developmental growth; • регуляція експресії генів; • RNA repair; • DNA demethylation; • positive chemotaxis; • обмін речовин; • neuron projection development; • GO:0100026 Репарація ДНК; • regulation of translation; • tRNA wobble cytosine modification; • regulation of translational initiation; • regulation of translational elongation; • oxidative single-stranded DNA demethylation; • regulation of mitochondrial translation; • tRNA demethylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	8846
	211064
	ENSG00000100601
	ENSMUSG00000079036
	Q13686
	P0CB42
	NM_001039506; NM_006020
	NM_001102565
	NP_006011
	NP_001096035
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ALKBH1 (англ. AlkB homolog 1, histone H2A dioxygenase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 389 амінокислот, а молекулярна маса — 43 832^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGKMAAAVGS	VATLATEPGE	DAFRKLFRFY	RQSRPGTADL	EGVIDFSAAH
AARGKGPGAQ	KVIKSQLNVS	SVSEQNAYRA	GLQPVSKWQA	YGLKGYPGFI
FIPNPFLPGY	QWHWVKQCLK	LYSQKPNVCN	LDKHMSKEET	QDLWEQSKEF
LRYKEATKRR	PRSLLEKLRW	VTVGYHYNWD	SKKYSADHYT	PFPSDLGFLS
EQVAAACGFE	DFRAEAGILN	YYRLDSTLGI	HVDRSELDHS	KPLLSFSFGQ
SAIFLLGGLQ	RDEAPTAMFM	HSGDIMIMSG	FSRLLNHAVP	RVLPNPEGEG
LPHCLEAPLP	AVLPRDSMVE	PCSMEDWQVC	ASYLKTARVN	MTVRQVLATD
QNFPLEPIED	EKRDISTEGF	CHLDDQNSEV	KRARINPDS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, ліаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, пошкодження ДНК, репарація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза. Локалізований у ядрі, мітохондрії.

Література ред.

Wei Y.F., Carter K.C., Wang R.P., Shell B.K. (1996). Molecular cloning and functional analysis of a human cDNA encoding an Escherichia coli AlkB homolog, a protein involved in DNA alkylation damage repair. Nucleic Acids Res. 24: 931—937. PMID 8600462 DOI:10.1093/nar/24.5.931
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Muller T.A., Meek K., Hausinger R.P. (2010). Human AlkB homologue 1 (ABH1) exhibits DNA lyase activity at abasic sites. DNA Repair. 9: 58—65. PMID 19959401 DOI:10.1016/j.dnarep.2009.10.011
Mueller T.A., Andrzejak M.M., Hausinger R.P. (2013). A covalent protein-DNA 5'-product adduct is generated following AP lyase activity of human ALKBH1 (AlkB homologue 1). Biochem. J. 452: 509—518. PMID 23577621 DOI:10.1042/BJ20121908
Silvestrov P., Mueller T.A., Clark K.N., Hausinger R.P., Cisneros G.A. (2014). Homology modeling, molecular dynamics, and site-directed mutagenesis study of AlkB human homolog 1 (ALKBH1). J. Mol. Graph. Model. 54: 123—130. PMID 25459764 DOI:10.1016/j.jmgm.2014.10.013

Примітки ред.

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17911 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 20 вересня 2017.
↑ UniProt, Q13686 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 20 вересня 2017.

Див. також ред.

Хромосома 14

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17911 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 20 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q13686 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 20 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]