AFAP1

AFAP1 (англ. Actin filament associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 730 амінокислот, а молекулярна маса — 80 725.

AFAP1
Ідентифікатори
Символи	AFAP1, AFAP, AFAP-110, AFAP110, actin filament associated protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608252 MGI: 1917542 HomoloGene: 11009 GeneCards: AFAP1
Онтологія гена Молекулярна функція • actin binding • SH3 domain binding • SH2 domain binding Клітинна компонента • цитоплазма • цитоскелет • focal adhesion • гіалоплазма • actin cytoskeleton Біологічний процес • regulation of signal transduction • regulation of cytoskeleton organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	60312	70292
Ensembl	ENSG00000196526	ENSMUSG00000029094
UniProt	Q8N556	Q80YS6
RefSeq (мРНК)	NM_001134647 NM_021638 NM_198595 NM_001371090 NM_001371091	NM_027373
RefSeq (білок)	NP_001128119 NP_940997 NP_001358019 NP_001358020	NP_081649 NP_001390348 NP_001390349 NP_001390350
Локус (UCSC)	Хр. 4: 7.76 – 7.94 Mb	Хр. 5: 36.05 – 36.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEELIVELRL		FLELLDHEYL		TSTVREKKAV		ITNILLRIQS		SKGFDVKDHA
QKQETANSLP		APPQMPLPEI		PQPWLPPDSG		PPPLPTSSLP		EGYYEEAVPL
SPGKAPEYIT		SNYDSDAMSS		SYESYDEEEE		DGKGKKTRHQ		WPSEEASMDL
VKDAKICAFL		LRKKRFGQWT		KLLCVIKDTK		LLCYKSSKDQ		QPQMELPLQG
CNITYIPKDS		KKKKHELKIT		QQGTDPLVLA		VQSKEQAEQW		LKVIKEAYSG
CSGPVDSECP		PPPSSPVHKA		ELEKKLSSER		PSSDGEGVVE		NGITTCNGKE
QVKRKKSSKS		EAKGTVSKVT		GKKITKIISL		GKKKPSTDEQ		TSSAEEDVPT
CGYLNVLSNS		RWRERWCRVK		DNKLIFHKDR		TDLKTHIVSI		PLRGCEVIPG
LDSKHPLTFR		LLRNGQEVAV		LEASSSEDMG		RWIGILLAET		GSSTDPEALH
YDYIDVEMSA		SVIQTAKQTF		CFMNRRVISA		NPYLGGTSNG		YAHPSGTALH
YDDVPCINGS		LKGKKPPVAS		NGVTGKGKTL		SSQPKKADPA		AVVKRTGSNA
AQYKYGKNRV		EADAKRLQTK		EEELLKRKEA		LRNRLAQLRK		ERKDLRAAIE
VNAGRKPQAI		LEEKLKQLEE		ECRQKEAERV		SLELELTEVK		ESLKKALAGG
VTLGLAIEPK		SGTSSPQSPV		FRHRTLENSP		ISSCDTSDTE		GPVPVNSAAV
LKKSQAAPGS		SPCRGHVLRK		AKEWELKNGT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Dorfleutner A., Stehlik C., Zhang J., Gallick G.E., Flynn D.C. (2007). AFAP-110 is required for actin stress fiber formation and cell adhesion in MDA-MB-231 breast cancer cells. J. Cell. Physiol. 213: 740—749. PMID 17520695 DOI:10.1002/jcp.21143

Див. також

• Хромосома 4