ACIN1

білок-кодуючий ген Homo Sapiens

ACIN1 (англ. Apoptotic chromatin condensation inducer 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 341 амінокислот, а молекулярна маса — 151 862[4].

ACIN1
Ідентифікатори
Символи ACIN1, ACINUS, ACN, fSAP152, apoptotic chromatin condensation inducer 1
Зовнішні ІД OMIM: 604562 MGI: 1891824 HomoloGene: 22853 GeneCards: ACIN1
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
NP_001158286
NP_001158287
NP_001158288
NP_001158289
NP_055792
Локус (UCSC) Хр. 14: 23.06 – 23.1 Mb Хр. 14: 54.64 – 54.69 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MWRRKHPRTSGGTRGVLSGNRGVEYGSGRGHLGTFEGRWRKLPKMPEAVG
TDPSTSRKMAELEEVTLDGKPLQALRVTDLKAALEQRGLAKSGQKSALVK
RLKGALMLENLQKHSTPHAAFQPNSQIGEEMSQNSFIKQYLEKQQELLRQ
RLEREAREAAELEEASAESEDEMIHPEGVASLLPPDFQSSLERPELELSR
HSPRKSSSISEEKGDSDDEKPRKGERRSSRVRQARAAKLSEGSQPAEEEE
DQETPSRNLRVRADRNLKTEEEEEEEEEEEEDDEEEEGDDEGQKSREAPI
LKEFKEEGEEIPRVKPEEMMDERPKTRSQEQEVLERGGRFTRSQEEARKS
HLARQQQEKEMKTTSPLEEEEREIKSSQGLKEKSKSPSPPRLTEDRKKAS
LVALPEQTASEEETPPPLLTKEASSPPPHPQLHSEEEIEPMEGPAPAVLI
QLSPPNTDADTRELLVSQHTVQLVGGLSPLSSPSDTKAESPAEKVPEESV
LPLVQKSTLADYSAQKDLEPESDRSAQPLPLKIEELALAKGITEECLKQP
SLEQKEGRRASHTLLPSHRLKQSADSSSSRSSSSSSSSSRSRSRSPDSSG
SRSHSPLRSKQRDVAQARTHANPRGRPKMGSRSTSESRSRSRSRSRSASS
NSRKSLSPGVSRDSSTSYTETKDPSSGQEVATPPVPQLQVCEPKERTSTS
SSSVQARRLSQPESAEKHVTQRLQPERGSPKKCEAEEAEPPAATQPQTSE
TQTSHLPESERIHHTVEEKEEVTMDTSENRPENDVPEPPMPIADQVSNDD
RPEGSVEDEEKKESSLPKSFKRKISVVSATKGVPAGNSDTEGGQPGRKRR
WGASTATTQKKPSISITTESLKSLIPDIKPLAGQEAVVDLHADDSRISED
ETERNGDDGTHDKGLKICRTVTQVVPAEGQENGQREEEEEEKEPEAEPPV
PPQVSVEVALPPPAEHEVKKVTLGDTLTRRSISQQKSGVSITIDDPVRTA
QVPSPPRGKISNIVHISNLVRPFTLGQLKELLGRTGTLVEEAFWIDKIKS
HCFVTYSTVEEAVATRTALHGVKWPQSNPKFLCADYAEQDELDYHRGLLV
DRPSETKTEEQGIPRPLHPPPPPPVQPPQHPRAEQREQERAVREQWAERE
REMERRERTRSEREWDRDKVREGPRSRSRSRDRRRKERAKSKEKKSEKKE
KAQEEPPAKLLDDLFRKTKAAPCIYWLPLTDSQIVQKEAERAERAKEREK
RRKEQEEEEQKEREKEAERERNRQLEREKRREHSRERDRERERERERDRG
DRDRDRERDRERGRERDRRDTKRHSRSRSRSTPVRDRGGRR

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література ред.

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Tange T.O., Shibuya T., Jurica M.S., Moore M.J. (2005). Biochemical analysis of the EJC reveals two new factors and a stable tetrameric protein core. RNA. 11: 1869—1883. PMID 16314458 DOI:10.1261/rna.2155905
  • Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
  • Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
  • Murachelli A.G., Ebert J., Basquin C., Le Hir H., Conti E. (2012). The structure of the ASAP core complex reveals the existence of a Pinin-containing PSAP complex. Nat. Struct. Mol. Biol. 19: 378—386. PMID 22388736 DOI:10.1038/nsmb.2242
  • Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111

Примітки ред.

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17066 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
  4. UniProt, Q9UKV3 (англ.) . Архів оригіналу за 31 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також ред.