Вікіпедія

Наноархеоти

Наноархеоти (лат. Nanoarchaeota) — четвертий тип в домені Археї[1]. Відкритий в 2002 рік у[2].

Єдиний відомий на сьогодні вид — Nanoarchaeum equitans. Його представники можуть розвиватися тільки сукупно з археями роду Ignicoccus (що належить до типу Crenarchaeota), це є унікальне явище для архей. На одній клітці Ignicoccus селиться від 2 до 4 клітин Nanoarchaeum equitans, діаметр яких 0,35-0,50 мкм. У місці контакту клітин прикріпних структур не виявлено. Відділення Nanoarchaeum equitans від клітинIgnicoccusможе бути викликано м'яким впливом ультразвуку. При спільному культивуванні в штучних умовах на пізній експоненційної фазі росту спостерігалося самостійне відділення близько 80% клітин Nanoarchaeum equitans від Ignicoccus.
Метаболізм Nanoarchaeum equitans поки не відомий. Вони не розмножуються у відсутності живих клітин Ignicoccus. Nanoarchaeum equitansсуворі анаероби. Температура, при якій живуть ці археї становить 90 °C.
Їхній геном відсеквентований і становить 490 885 пар основ. Це один з найменших клітинних геномів, який поки що вдалося знайти (менший геном у ендосімбіотіческой бактерії Carsonella). У Nanoarchaeum equitans залишилися тільки гени, що відповідають за біосинтез білка, реплікацію, транскрипцію і трансляцію, 95% геному кодує білки.
Nanoarchaeum equitans не можуть синтезувати ліпіди, нуклеотиди і амінокислоти, отримуючи їх від Ignicoccus. Можливо, вони також залежать від енергетичного метаболізму господаря. Швидкість зростання Ignicoccus у чистій культурі і змішаній культурі при невисокій чисельності Nanoarchaeum equitans не розрізняється, але дуже велике число наноархей (кілька на кожну клітину господаря) пригнічує розвиток Ignicoccus. У зв'язку з цим Nanoarchaeum equitans можна розглядати як паразитів, що робить їх єдиними відомими паразитами серед архей.[3]
Nanoarchaeum equitans, виділені з гарячих сірчаних джерел Серединно-Атлантичного хребта на глибині 106 метрів. Пізніше 16s рРНК наноархей з послідовностями, схожими на Nanoarchaeum equitans, виявили в Тихому океані, в гейзерах Йєллоустоуна і Камчатки. Методом FISH встановлено, що всі Nanoarchaeota прикріплюються до клітин інших архей.

Примітки ред.

  1. ↑ Див NCBI Nanoarchaeota [Архівовано 12 вересня 2019 у Wayback Machine.]. NCBI taxonomy resources. National Center for Biotechnology Information. Архів оригіналу за 27 травня 2018. Процитовано 28 січня 2008.
  2. ↑ H. Huber,et al.(2002) «A new phylum of Archaea represented by a nanosized hyperthermophilic symbiont»,Nature , 417: 63-7. PubMed entry: [1] [Архівовано 10 липня 2020 у Wayback Machine.]
  3. ↑ E. Waters, et al. (2003) «The genome of Nanoarchaeum equitans: insights into early archaeal evolution and derived parasitism» [Архівовано 6 липня 2008 у Wayback Machine.], PNAS, 100: 12984-8 .

Література ред.

  • Hohn, MJ; Hedlund BP, Huber H (2002). Detection of 16S rDNA sequences representing the novel phylum 'Nanoarchaeota': indication for a wide distribution in high temperature biotopes. Syst. Appl. Microbiol. 25 (4): 551—554. doi:10.1078/07232020260517698. PMID 12583716.
  • Huber, H; Hohn MJ, Rachel R, Fuchs T, Wimmer VC, Stetter KO (2002). A new phylum of Archaea represented by a nanosized hyperthermophilic symbiont. Nature. 417 (6884): 63—67. doi:10.1038/417063a. PMID 11986665.
  • Stackebrandt, E; Frederiksen W, Garrity GM, Grimont PA, Kampfer P, Maiden MC, Nesme X, Rossello-Mora R, Swings J, Truper HG, Vauterin L, Ward AC, Whitman WB (2002). Report of the ad hoc committee for the re-evaluation of the species definition in bacteriology. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52 (Pt 3): 1043—1047. doi:10.1099/ijs.0.02360-0. PMID 12054223.
  • Christensen, H; Bisgaard M, Frederiksen W, Mutters R, Kuhnert P, Olsen JE (2001). Is characterization of a single isolate sufficient for valid publication of a new genus or species? Proposal to modify recommendation 30b of the Bacteriological Code (1990 Revision). Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 6): 2221—2225. PMID 11760965.
  • Gurtler, V; Mayall BC (2001). Genomic approaches to typing, taxonomy and evolution of bacterial isolates. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 1): 3—16. PMID 11211268.
  • Dalevi, D; Hugenholtz P, Blackall LL (2001). A multiple-outgroup approach to resolving division-level phylogenetic relationships using 16S rDNA data. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 2): 385—391. PMID 11321083.
  • Keswani, J; Whitman WB (2001). Relationship of 16S rRNA sequence similarity to DNA hybridization in prokaryotes. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 2): 667—678. PMID 11321113.
  • Young, JM (2001). Implications of alternative classifications and horizontal gene transfer for bacterial taxonomy. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 3): 945—953. PMID 11411719.
  • Christensen, H; Angen O, Mutters R, Olsen JE, Bisgaard M (2000). DNA-DNA hybridization determined in micro-wells using covalent attachment of DNA. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50: 1095—1102. PMID 10843050.
  • Xu, HX; Kawamura Y, Li N, Zhao L, Li TM, Li ZY, Shu S, Ezaki T (2000). A rapid method for determining the G+C content of bacterial chromosomes by monitoring fluorescence intensity during DNA denaturation in a capillary tube. Int. J. Syst.Evol. Microbiol. 50: 1463—1469. PMID 10939651.
  • Young, JM (2000). Suggestions for avoiding on-going confusion from the Bacteriological Code. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50: 1687—1689. PMID 10939677.
  • Hansmann, S; Martin W (2000). Phylogeny of 33 ribosomal and six other proteins encoded in an ancient gene cluster that is conserved across prokaryotic genomes: influence of excluding poorly alignable sites from analysis. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50: 1655—1663. PMID 10939673.
  • Tindall, BJ (1999). Proposal to change the Rule governing the designation of type strains deposited under culture collection numbers allocated for patent purposes. Int. J. Syst. Bacteriol. 49: 1317—1319. doi:10.1099/00207713-49-3-1317. PMID 10490293.
  • Tindall, BJ (1999). Proposal to change Rule 18a, Rule 18f and Rule 30 to limit the retroactive consequences of changes accepted by the ICSB. Int. J. Syst. Bacteriol. 49: 1321—1322. doi:10.1099/00207713-49-3-1321. PMID 10425797.
  • Palys, T; Nakamura LK, Cohan FM (1997). Discovery and classification of ecological diversity in the bacterial world: the role of DNA sequence data. Int. J. Syst. Bacteriol. 47 (4): 1145—1156. doi:10.1099/00207713-47-4-1145. PMID 9336922.
  • Euzeby, JP (1997). List of Bacterial Names with Standing in Nomenclature: a folder available on the Internet. Int. J. Syst. Bacteriol. 47 (2): 590—592. doi:10.1099/00207713-47-2-590. PMID 9103655.
  • Clayton, RA; Sutton G, Hinkle PS Jr, Bult C, Fields C (1995). Intraspecific variation in small-subunit rRNA sequences in GenBank: why single sequences may not adequately represent prokaryotic taxa. Int. J. Syst. Bacteriol. 45 (3): 595—599. doi:10.1099/00207713-45-3-595. PMID 8590690.
  • Murray, RG; Schleifer KH (1994). Taxonomic notes: a proposal for recording the properties of putative taxa of procaryotes. Int. J. Syst. Bacteriol. 44 (1): 174—176. doi:10.1099/00207713-44-1-174. PMID 8123559.
  • Winker, S; Woese CR (1991). A definition of the domains Archaea, Bacteria and Eucarya in terms of small subunit ribosomal RNA characteristics. Syst. Appl. Microbiol. 14 (4): 305—310. PMID 11540071.
  • Achenbach-Richter, L; Woese CR (1988). The ribosomal gene spacer region in archaebacteria. Syst. Appl. Microbiol. 10: 211—214. PMID 11542149.
  • McGill, TJ; Jurka J, Sobieski JM, Pickett MH, Woese CR, Fox GE (1986). Characteristic archaebacterial 16S rRNA oligonucleotides. Syst. Appl. Microbiol. 7: 194—197. PMID 11542064.
  • Woese, CR; Olsen GJ (1984). The phylogenetic relationships of three sulfur dependent archaebacteria. Syst. Appl. Microbiol. 5: 97—105. PMID 11541975.


На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.
Отримано з https://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=Наноархеоти&oldid=37774558