Мезодерма — один із зародкових листків, які формують ембріон тришарових тварин. Мезодерма утворюється в ході гаструляції, завдяки міграції клітин з ектодерми, або внаслідок випинання та відокремлення карманів первинної кишки.

Формування мезодерми у морського їжака з первинної та вторинної мезенхіми, утворених при міграції клітин ектодерми
Формування мезодерми у ланцетника шляхом випинання карманів первинної кишки

Еволюційно виникнення мезодерми було важливим ароморфозом, що дав початок розвитку майже всім тваринам із складною будовою тіла. Виникнення мезодерми стало також і передумовою для розвитку целома (хоча він існує і не у всіх тришарових тварин).

Загалом, з мезодерми утворюються такі системи органів: